耳为肾之窍，手足少阳经之脉布于耳，手足太阳经、阳四经亦行于耳前后，所以说耳为"宗脉之所聚"。 《素问·金匮真言论》中说："南方赤色，入通于心，开窍于耳。"可见耳诊可察知心脏功能。据现代耳针疗法研究发现，耳部有脏腑与身体相关部位的区域划分，而且，人体内脏在耳部的反射区分布是有规律的。经常按摩耳朵，对体内各脏腑皆有很好的保健效果。根据相应部位取穴内脏器官、肢体等发生病变，在耳郭相应部位有压痛点(或反应点)，可作为取穴的根据。例如胃病取胃穴，踝关节扭伤取踝穴等，可用钝头探棒查找出压痛点。根据中医理论辨证取穴根据中医脏腑学说，肝与胆，心与小肠，肾与膀胱，脾与胃互为表里，因而肝病又取胆穴，心脏病取小肠穴，肠炎取肺穴。中医有肝开窍于目，心开窍于舌，脾开窍于口(唇)，肺开窍于鼻，肾开窍于耳的理论，因而一般来说眼病取肝穴，中耳炎取肾穴，鼻炎取肺穴。据肝主筋，心主血，脾主肌肉，肺主皮毛，肾主骨的理论，皮肤病应取肺穴，骨科病应取肾穴，肌肉病应取脾穴。根据西医理论取穴皮质下穴有调节大脑皮层的功能，因而神经系统的病症要取皮质下穴；交感穴有调节自主神经的功能，因而内脏病痛要取交感穴；平喘穴有调节呼吸中枢及抗过敏的功能，因而哮喘要取平喘穴。根据临床经验取穴通过大量临床实践，得出治疗疾病的有效耳穴。如眼穴、肝穴、脾穴能治疗麦粒肿；颈椎穴、颈穴、神门穴、外生殖器穴能治疗落枕；枕穴、额穴、枕小神经穴、皮质下穴能治疗头痛。